Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPCAL1P37235 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms