Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD12P35452 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms