Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB9P28065 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB9P28065 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms