Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms