Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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