Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD3DP04234 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD3DP04234 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD3DP04234 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD3DP04234 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD3DP04234 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms