Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRATO95237 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRATO95237 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRATO95237 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRATO95237 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRATO95237 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRATO95237 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRATO95237 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms