Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms