Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TIMM17BO60830 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms