Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms