Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms