Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF8Q9UPP1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms