Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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RABGEF1Q9UJ41 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGEF1Q9UJ41 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGEF1Q9UJ41 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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