Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCNX1Q96RV3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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