Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB3IPQ96QF0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms