Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms