Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00116Q8NCU8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms