Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms