Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBGT1Q8N5D6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms