Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms