Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms