Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HES3Q5TGS1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms