Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICAQ29983 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MICAQ29983 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MICAQ29983 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICAQ29983 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICAQ29983 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICAQ29983 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms