Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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