Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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