Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms