Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL3Q13618 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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