Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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