Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL28Q13084 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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