Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK16Q00536 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms