Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL39P62891 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL39P62891 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms