Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PAX9P55771 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms