Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms