Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GSK3BP49841 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms