Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP214P35658 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms