Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP1P29466 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP1P29466 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms