Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMBRP28336 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms