Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMBP08118 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMBP08118 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMBP08118 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms