Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-AP01891 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms