Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA2P01563 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA2P01563 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms