Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP3O75154 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms