Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN1O60240 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms