Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms