Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXND1Q9Y4D7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXND1Q9Y4D7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms