Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIMS3Q9UJD0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms