Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLKQ9UBT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms