Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PGPEP1Q9NXJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PGPEP1Q9NXJ5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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