Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FZD3Q9NPG1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms