Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms