Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC7Q96M83 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms